Nous sommes en pleine guerre totale.
Konoha et Suna sont en guerre pour des raisons inconnues... L'un croit que l'autre a voulut s'emparer de son bijuu, l'autre que son ex-allié à mit des espions au service de l'Akatsuki.
L'Akatsuki prépare une arme et domine Kiri. Ils attaquent le monde entier, visant plus précisément Konoha et Suna.
Oto, ayant été récemment détruit, essaye de se reconstruire du mieux qu'il peut.
Iwa et Kumo ont été détruits.